Режим на санкции се прилага в случай на неспазване на задължението за отчитане по Интрастат/EMEBI (бивш DEB във Франция) или грешки в декларацията, в съответствие с членове 1788e от Френския общ данъчен кодекс (CGI) и 467-4 от Митническия кодекс.
Налага се глоба от €750 за всяка липсваща или закъсняла декларация. Тази санкция може да бъде удвоена до €1,500, ако декларантът не уреди ситуацията си в рамките на 30 дни след официалното уведомление. Освен това, всяко пропускане или грешка в декларацията води до глоба от €15, ограничена до общо €1,500.
Освен това, митническите органи имат широки правомощия за проверка на декларациите по Интрастат/EMEBI: те могат да изискват информация, да изискват допълнителни декларации и да провеждат срещи. Неправилното спазване на сроковете за отговор може да доведе до финансови санкции.