Se aplica un régimen de sanciones en caso de incumplimiento de la obligación de declaración Intrastat/EMEBI (anteriormente DEB en Francia) o de errores en la declaración, de acuerdo con los artículos 1788e del Código General de Impuestos francés (CGI) y 467-4 del Código Aduanero.
Se impone una multa de 750 € por cada declaración ausente o presentada con retraso. Esta sanción puede duplicarse a 1.500 € si el declarante no regulariza su situación en un plazo de 30 días tras la notificación formal. Además, cada omisión o error en una declaración conlleva una multa de 15 €, limitada a un total de 1.500 €.
Asimismo, las autoridades aduaneras tienen amplios poderes para auditar las declaraciones Intrastat/EMEBI: pueden solicitar información, exigir declaraciones complementarias y celebrar reuniones. No cumplir con los plazos de respuesta puede resultar en sanciones económicas.